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    简化基因组甲基化测序(RRBS)
    简化基因组甲基化测序(RRBS)

    一、产品概述


    DNA甲基化是最早被发明、也是研讨最深化的表观遗传调控机制之一。DNA甲基化(DNA methylation)为DNA化学修饰的一种情势,可以在不改动DNA序列的条件下,改动遗传体现。所谓DNA甲基化是指在DNA甲基化转移酶的作用下,在基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶5号碳位共价键联合一个甲基基团。少量研讨标明,DNA甲基化能惹起染布局、DNA构象、DNA波动性及DNA与卵白质互相作用方法的改动,从而控制基因表达。


    强化版简化基因组甲基化测序(Improved Reduced Representation Bisulfite Sequencing)是经过 MSPI 酶切富集基因组 DNA 上 CCGG 位点的片断,经Bisulfite 处置和高通量测序,举行全基因组范畴、单碱基辨别率的甲基化测序,普遍用临床及哺乳植物全基因组范畴甲基化研讨,人样本可以检测高达 8M 以上无效 CpG 位点, 掩盖>90%的 CpG 岛, >85%的启动子。


    实行原理


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    RRBS是基于重亚硫酸盐的甲基化剖析办法,起首使用限定性内切酶对基因组举行酶切,经Bisulfite处置,对基因组CpG地区举行测序的技能。


    三、使用偏向


    • 临床大样本甲基化 Biomarker 挑选

    • 形式生物发育甲基化谱研讨

    • 疾病及肿瘤调控机制研讨

    • 遗传育种(植物)甲基化研讨

    • 无参基因组物种甲基化研讨


    四、使用案例


    Epimutations in developmental genes underlie the onset of domestication in farmed European sea bass.( Mol Biol Evol,2019,IF= 14.797).

    本研讨经过RRBS测序,比力了晚期驯化的 (N=12)与野生的(N=12) 欧洲鲈鱼在驯化历程中DNA甲基化变革,发明晚期驯化的鲈鱼与野生的没有遗传差别,但在差别胚胎劈头的构造中产生DNA甲基化变革。这些甲基化渐变与颠末25年选择性育种后的胞嘧啶至胸腺嘧啶多态性明显重叠,表观渐变基因与正选择基因分歧。后果标明驯化初始阶的表观变异(epimutation)是一个紧张事情。

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