j9九游会登录--值得信赖

您的地位:首页 >> 科研办事 >>  目的地区甲基化测序(TBS测序)
目的地区甲基化测序(TBS测序)
目的地区甲基化测序(TBS测序)

一、产品概述


DNA甲基化是最早被发明、也是研讨最深化的表观遗传调控机制之一。DNA甲基化(DNA methylation)为DNA化学修饰的一种情势,可以在不改动DNA序列的条件下,改动遗传体现。所谓DNA甲基化是指在DNA甲基化转移酶的作用下,在基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶5号碳位共价键联合一个甲基基团。少量研讨标明,DNA甲基化能惹起染布局、DNA构象、DNA波动性及DNA与卵白质互相作用方法的改动,从而控制基因表达。



TBS全称Targeted Bisulfite Sequencing,即目的地区甲基化测序。BSP (Bisulfite Sequencing PCR)联合高通量测序的TBS满意几个到上百个基因/位点的验证需求, 具有高通量、低本钱的上风, 普遍用于临床大样本多位点的甲基化 biomarker 挑选及高程度文章甲基化验证关键。


实行原理


图片1.png 



图片2.png 

WGBS是基于重亚硫酸盐的甲基化剖析办法,起首经过Bisulfite对样本DNA举行处置,将未甲基化的C碱基转化为U碱基,而甲基化的C碱基则不会改动,举行PCA扩增后U碱基会酿成T,与本来甲基化的C碱基区离开,再联合高通量测序技能,可绘制单碱基辨别率的全基因组DNA甲基化图谱。RRBS是使用限定性内切酶对基因组举行酶切,经Bisulfite处置,对基因组CpG地区举行测序的技能。


三、使用偏向


  • 临床大样本甲基化 Biomarker 挑选

  • 形式生物发育甲基化谱研讨

  • 疾病及肿瘤调控机制研讨

  • 遗传育种(植物)甲基化研讨

  • 无参基因组物种甲基化研讨



四、使用案例


DNA methylation and copy number variation profiling of T-cell lymphoblastic leukemia and lymphoma.(Blood Cancer Jornal,2020,IF=8.023)

作者经过主身分剖析(PCA),探究成人和儿童T-ALL和T-LBL患者样本以及参考样本的全基因组DNA甲基化形式(图1)。PCA没有将T-ALL和T-LBL投影为独自的集群,也没有将第一和第二主身分中的患者年事组辨别聚类(图1)。但是,非恶性参考样本(骨髓和淋逢迎样本)与T-ALL和T-LBL样天职开收集证明了正常构造和恶性构造之间存在较大的甲基化变异。该文章进一步剖析了T细胞淋巴母细胞恶性肿瘤中基于DNA甲基化的异质性,并探求可用于区分两种疾病的表观遗传标志,以深化理解两种肿瘤差别临床体现面前的生物学机制,并展现新的医治靶点和战略。

图片3.png 



lz2.jpg上海工商 标识编号2018092921030019

 ©2018 上海j9九游生物 All Right Reserved.

存案号:
Copyright End